Kalendář akcí

16.02.2021

Plenární zasedání Učené společnosti

2. část: zajišťuje II. sekce věd chemických Přednáška: P. Jelínek: Exkurze do světa molekul pomocí rastrovací mikroskopie

16.03.2021

Plenární zasedání Učené společnosti

2. část: zajišťuje III. sekce věd biologicko-medicínských O. Prášil: Pěstování a využití řas a sinic

20.04.2021

Plenární zasedání Učené společnosti

2. část: zajišťuje IV. sekce věd společenských a humanitních Přednáška: T. Kostelecký (název bude upřesněn)

Šponer Jiří

prof., RNDr., DrSc.
Born March 2, 1964 in Brno

  • Molecular Biophysics and Computational Chemistry
  • Member of Learned Society since 2006

Educational and professional preparation:

  • 1987, Master degree (RNDr), Physics, Faculty of Science, Masaryk University, Brno 
  • 1992, CSc. (eq. PhD), Biophysics, Faculty of Science, Masaryk University, Brno 
  • 2001, DrSc. (Doctor of Science), Biophysics/Molecular Biology, Academy of Sciences of the Czech Republic

Employment and academic positions: 

  • 1988–1989, Scholarship, Masaryk University, Faculty of Science, Masaryk University, Brno (including one-year army service).
  • 1989–1992, Postgraduate student, Faculty of Medicine, Masaryk University, Brno.  
  • 1992, Scholarship, assistant professor, Masaryk University, Faculty of Science, Brno.
  • 1993, Junior researcher, Institute of Biohysics, Academy of Sciences of the Czech Republic, Brno 
  • 1994–2003, Researcher and Senior Research, J. Heyrovský Institute of Physical Chemistry, Academy of Sciences of the Czech Republic, Prague (part time 2001–2003).  
  • 2001-present: Senior Researcher and Head of Laboratory of Structure and Dynamics of Nucleic Acids, Institute of Biophysics, Academy of Sciences of the Czech Republic, Brno. 
  • 2004-present: (part time) Senior researcher, Institute of Organic Chemistry and Biochemistry, Academy of Sciences of the Czech Republic, Prague.

Membership in selected domestic scientific bodies:

  • Member of the Scientific Council of the Institute of Biophysics, AS CR, Brno. Since 2001

Notable awards:

  • 1999, Prize od the Learned Society of the Czech Republic for junior scientists
  • 2000, Prize of the Ministry of Education of the Czech Republic

Selected publications:

  • Šponer J., Hobza P.: Nonplanar geometries of DNA bases. Second order Moller-Plesset study. J. Phys. Chem. 98, 1994, 3161-3164.
  • Šponer J., Leszczynski J., Hobza P.: Structures and energies of hydrogen-bonded DNA base pairs. A nonempirical study with inclusion of electron correlation. J. Phys. Chem. 100, 1996, 1965-1974.
  • Šponer J., Leszczynski, J., Hobza P.: On the nature of nucleic acid base stacking. Nonempirical ab initio and empirical potential characterization of 10 stacked base pairs. Comparison of stacked and H-bonded base pairs. J. Phys. Chem. 100, 1996, 5590-5596.
  • Špacková N., Berger I., Šponer J.: Nanosecond molecular dynamics simulations of parallel and antiparallel guanine quadruplex molecules. J. Am. Chem. Soc. 121, 1999, 5519-5534.
  • Hobza P., Šponer J.: Structure, energetics, and dynamics of the nucleic acid base pairs: Nonempirical ab initio calculations. Chem. Rev. 99, 1999, 3247-3276.
  • Štefl R., Cheatham T. E, Špačková, N., Fadrná E., Berger I., Koča J., Šponer J.: Formation pathways  of  a  guanine-quadruplex  DNA  revealed  by  molecular  dynamics and thermodynamic analysis of the substates. Biophys. J. 85, 2003, 1787-1804.
  • Šponer J., Jurečka P., Hobza P.:   Accurate interaction energies of hydrogen-bonded nucleic acid base pairs. J. Am. Chem. Soc. 126, 2004, 10142–10151.
  • Krasovska M. V., Sefcikova J., Špačková N., Šponer J., Walter N. G.: Structural dynamics of precursor and product of the RNA enzyme from the hepatitis delta virus as revealed by molecular dynamics simulations. J. Mol. Biol. 351, 2005, 731-748.
  • Rázga F., Koča J., Šponer J., Leontis N.B.: Hinge-like motions in RNA kink-turns: The role of the second A-minor motif and nominally unpaired bases. Biophys. J. 88, 2005, 3466-3485.
  • Computational studies of DNA and RNA. Šponer J., Lankaš F., Eds., Springer, 2006 

Biofyzikální ústav AV ČR »
Institute of Biophysics, AS CR »

Zpět na seznam článků

Novinky

13.01.21

Pozvánka na online přednášku prof. RNDr. Jiřího Zahradníka, DrSc.: Seismologie - fyzikální bádání, společenský přínos a očekávání

Učená společnost ČR Vás srdečně zve na přednášku prof. RNDr. Jiřího Zahradníka, DrSc. (Matematicko-fyzikální fakulta Univerzity Karlovy): "Seismologie - fyzikální bádání, společenský přínos a očekávání", která se koná v úterý 19. 1. 2021 v 16:00 hod online na YouTube: http://seismologie.jdem.cz. Studium zemětřesení a struktury Země pomocí seismických vln poskytuje 3D obraz nitra a tektonických procesů, s šancí uplatnit se i při planetárních výzkumech. Hlavními společenskými produkty jsou rychlé odhady účinků zemětřesení v reálném čase, předpověď ohrožení dotřesy, a systémy rychlého varování před ničivými kmity i před tsunami, hodnocení dlouhodobého ohrožení kritických lokalit a vývoj stavebních norem i antiseimických opatření.

Pozvánka (PDF, 325 kB)

11.01.21

Otevřený dopis ministru školství – žádost o zachování finanční podpory „EMBO Installation Grant“

„Vážený pane ministře, dovolujeme si obrátit se na Vás s žádostí o zachování finanční podpory EMBO Installation Grant. Ukončení financování tohoto programu by mělo dalekosáhlý negativní dopad na rozvoj molekulárně-biologického a biomedicínského výzkumu v České republice,“ píše Rada Učené společnosti ČR v otevřeném dopise ministru školství Robertu Plagovi.

08.01.21

Úmrtí člena Učené společnosti prof. Oldřicha Kowalskeho

2. ledna 2021 zemřel ve věku 84 let člen Učené společnsosti prof. RNDr. Oldřich Kowalski, DrSc., jeden z nejvýznamnějších českých geometrů. Působil na Matematicko-fyzikální fakultě Univerzity Karlovy v Praze, kde se stal v roce 1992 profesorem a v poslední době působil jako emeritní profesor. Odborně se profesor Kowalski věnoval moderní diferenciální geometrii, zejména Riemannově geometrii. K rozvoji geometrie přispěl profesor Kowalski kromě pečlivě připravených přednášek pro matematiky i pro fyziky na MFF UK i napsáním dvou skript. Je autorem nebo spoluautorem 170 vědeckých publikací v mezinárodních časopisech a 4 monografií.  Kromě své vědecké a pedagogické práce se profesor Kowalski angažoval i společensky. V letech 1971–2001, tedy celých 30 let, vedl časopis Pokroky matematiky, fyziky a astronomie.