Kalendář akcí

10.12.2019

Adventní setkání

21.01.2020

Plenární zasedání Učené společnosti

2. část: zajišťuje I. sekce věd matematicko-fyzikálníchPřednáška: D. Černý: Etika umělé inteligence

18.02.2020

Plenární zasedání Učené společnosti

2. část: zajišťuje II. sekce věd chemických

Nadační fond

Šponer Jiří

prof., RNDr., DrSc.
Born March 2, 1964 in Brno

  • Molecular Biophysics and Computational Chemistry
  • Member of Learned Society since 2006

Educational and professional preparation:

  • 1987, Master degree (RNDr), Physics, Faculty of Science, Masaryk University, Brno 
  • 1992, CSc. (eq. PhD), Biophysics, Faculty of Science, Masaryk University, Brno 
  • 2001, DrSc. (Doctor of Science), Biophysics/Molecular Biology, Academy of Sciences of the Czech Republic

Employment and academic positions: 

  • 1988–1989, Scholarship, Masaryk University, Faculty of Science, Masaryk University, Brno (including one-year army service).
  • 1989–1992, Postgraduate student, Faculty of Medicine, Masaryk University, Brno.  
  • 1992, Scholarship, assistant professor, Masaryk University, Faculty of Science, Brno.
  • 1993, Junior researcher, Institute of Biohysics, Academy of Sciences of the Czech Republic, Brno 
  • 1994–2003, Researcher and Senior Research, J. Heyrovský Institute of Physical Chemistry, Academy of Sciences of the Czech Republic, Prague (part time 2001–2003).  
  • 2001-present: Senior Researcher and Head of Laboratory of Structure and Dynamics of Nucleic Acids, Institute of Biophysics, Academy of Sciences of the Czech Republic, Brno. 
  • 2004-present: (part time) Senior researcher, Institute of Organic Chemistry and Biochemistry, Academy of Sciences of the Czech Republic, Prague.

Membership in selected domestic scientific bodies:

  • Member of the Scientific Council of the Institute of Biophysics, AS CR, Brno. Since 2001

Notable awards:

  • 1999, Prize od the Learned Society of the Czech Republic for junior scientists
  • 2000, Prize of the Ministry of Education of the Czech Republic

Selected publications:

  • Šponer J., Hobza P.: Nonplanar geometries of DNA bases. Second order Moller-Plesset study. J. Phys. Chem. 98, 1994, 3161-3164.
  • Šponer J., Leszczynski J., Hobza P.: Structures and energies of hydrogen-bonded DNA base pairs. A nonempirical study with inclusion of electron correlation. J. Phys. Chem. 100, 1996, 1965-1974.
  • Šponer J., Leszczynski, J., Hobza P.: On the nature of nucleic acid base stacking. Nonempirical ab initio and empirical potential characterization of 10 stacked base pairs. Comparison of stacked and H-bonded base pairs. J. Phys. Chem. 100, 1996, 5590-5596.
  • Špacková N., Berger I., Šponer J.: Nanosecond molecular dynamics simulations of parallel and antiparallel guanine quadruplex molecules. J. Am. Chem. Soc. 121, 1999, 5519-5534.
  • Hobza P., Šponer J.: Structure, energetics, and dynamics of the nucleic acid base pairs: Nonempirical ab initio calculations. Chem. Rev. 99, 1999, 3247-3276.
  • Štefl R., Cheatham T. E, Špačková, N., Fadrná E., Berger I., Koča J., Šponer J.: Formation pathways  of  a  guanine-quadruplex  DNA  revealed  by  molecular  dynamics and thermodynamic analysis of the substates. Biophys. J. 85, 2003, 1787-1804.
  • Šponer J., Jurečka P., Hobza P.:   Accurate interaction energies of hydrogen-bonded nucleic acid base pairs. J. Am. Chem. Soc. 126, 2004, 10142–10151.
  • Krasovska M. V., Sefcikova J., Špačková N., Šponer J., Walter N. G.: Structural dynamics of precursor and product of the RNA enzyme from the hepatitis delta virus as revealed by molecular dynamics simulations. J. Mol. Biol. 351, 2005, 731-748.
  • Rázga F., Koča J., Šponer J., Leontis N.B.: Hinge-like motions in RNA kink-turns: The role of the second A-minor motif and nominally unpaired bases. Biophys. J. 88, 2005, 3466-3485.
  • Computational studies of DNA and RNA. Šponer J., Lankaš F., Eds., Springer, 2006 

Biofyzikální ústav AV ČR »
Institute of Biophysics, AS CR »

Zpět na seznam článků

Novinky

26.11.19

Prof Miroslav Bárta získal Národní cenu vlády Česká hlava

Člen Učené společnosti prof. Mgr. Miroslav Bárta, Dr. (Filozofická fakulta UK) převzal 25. 11. 2019 Národní cenu vlády Česká hlava. Profesor Bárta je významný český egyptolog a archeolog, zabývá se vývojem starověkých civilizací, vztahem člověka a přírodního prostředí a dlouhodobě též vývojem komplexních společností. Je vedoucím projektu Českého egyptologického ústavu pro archeologické a environmentální výzkumy v Egyptě a Súdánu. Jeho hlavním badatelským zájmem je období stavitelů pyramid za Staré říše.

19.11.19

Vystoupení prof. RNDr. Blanky Říhové, DrSc. v pořadu „Boj za pravdu“

Předsedkyně Učené společnosti prof. RNDr. Blanka Říhová, DrSc., vystoupila v úterý 12. 11. 2019 spolu s přednostou Ústavu etiky a humanitních studií 3. lékařské fakulty UK, teologem Mgr. Marem Váchou, Ph.D., v přímém přenosu měsíčníku FOCUS Václava Moravce na téma „Boj za pravdu“. V pořadu dále vystoupili prezidentka Slovenské republiky paní Zuzana Čaputová a předseda Ústavního soudu JUDr. Pavel Rychetský. Vysílání z Betlémské kaple se zúčastnilo také 400 studentů středních a vysokých škol, kteří hostům kladli otázky.
Pořad je možné zhlédnout zde

19.11.19

Jmenování prof. RNDr. Jana Trlifaje, DSc. za Fellow of the American Mathematical Society

Člen Učené společnosti prof. RNDr. Jan Trlifaj, DSc., byl jmenován za Fellow of the American Mathematical Society (AMS).
Tisková zpráva AMS  | Seznam letos jmenovaných Fellows